구 사와라군(早良郡)내 일곱 마을의 총본사(몇 개 신사의 제신을 한데 모아 제사지내는 신사)로서 제신은 '호무타와케노미코토(品陀和気命)', '이자나미노미코토(伊弉冉尊)', '다마요리비메(玉依毘賣命)'를 모시고 있다. 이전에는 상궁, 중궁, 하궁이 있어 이이모리산 전체가 신역이었다. 상궁 터의 산 정상은 1144년의 가와라교(瓦経-경전을 세겨 구운 기와)의 출토지로 가마쿠라시대(1185~1333)에는 300여 마을의 신사 영지를 영유하였으며, 난보쿠초시대(1336~1392)에는 각지각의 거점이 되어 유명한 이이모리산전투가 벌어졌다. 본전(시지정문화재)은 1650년에 건립되었으며, 난보쿠초시대의 송나라풍 사자 모양의 석상(현지정문화재), 이이모리신사 문서(시지정문화재)를 소장하고 있다. 또한, 신불혼합시대의 자취로 '이이모리신궁사 문수당'이 있어, 난보쿠초시대의 문수보살기사상(시지정문화재)을 안치하고 있다.